EM菌是 Effective Microorganisms 的英文縮寫，中文意思是有效微生物菌群。它是由功能各異的多種微生物組成的一種活菌製劑，對土壤惡化、連作障礙、作物的抗病抗逆能力、產量和品質等有著積極的作用。
EM菌的菌類成分及主要功能
EM菌是由光合菌群、乳酸菌群、酵母菌群、放線菌群、絲狀菌群等10屬80餘種微生物組成的生物製劑。
光合菌群
①以土壤接受的光和熱為能源，將土壤中硫氫和碳氫化合物中的氫分離出來，變有害物質為無害物質。
②以植物根部的分泌物、土壤中的有機物、有害氣體(硫化氫等)及二氧化碳、氮等為基質，合成醣類、氨基酸類、維生素類、氮素化合物、抗病毒物質和生理活性物質等，是肥沃土壤和促進動植物生長的主要力量。
③光合菌群的代謝物質可以被植物直接吸收，還可以成為其他有益微生物繁殖的養分。
乳酸菌群
①靠攝取光合細菌、酵母菌產生的醣類形成乳酸。乳酸具有很強的殺菌能力，能有效抑制有害微生物的活動和有機物的急劇腐敗分解。
②能夠分解在常態下不易分解的木質素和纖維素，並使有機物發酵分解。
③能夠抑制連作障礙產生的致病菌增殖。
酵母菌群
①利用植物根部產生的分泌物 、光合菌合成的氨基酸、醣類及其他有機物質產生髮酵力， 合成促進根系生長及細胞分裂的活性物質。
②給可促進其他有效微生物(如乳酸菌、放線菌)增殖所需要的基質，提供重要的給養保障。
③產生的單細胞蛋白是動物不可缺少的養分。
放線菌群
①從光合細菌中獲取氨基酸、氮素等作為基質，產生出各種抗生物質、維生素及酶，可以直接抑制病原菌。
②提前獲取有害病菌增殖所需要的基質，從而抑制它們的增殖，並創造出其他有益微生物增殖的生存環境。
③對難分解的木質素、纖維素、甲殼素等具有降解作用，並容易被動植物吸收， 增強動植物對各種病害的抵抗力和免疫力。
④促進固氮菌和VA菌增殖。固氮菌是細菌的一科，能固定空氣中的氮素。VA菌是最常見的一種和植物根系共生互惠的微生物，為作物提供多種礦質營養(尤其是磷)，同時也從作物中獲得自身所需的光合產物，在植物營養、養分循環、土壤改良等方面都具有非常重要的意義。
絲狀菌群
①能和其他微生物共存，尤其對土壤中酯的生成有良好效果。
②酒精生成力強，能防止蛆和其他害蟲的發生，並可以消除惡臭。
EM菌的具體作用
改良土壤
● 形成適於作物生長發育的良好環境，改良土壤結構，促進團粒化，提高土壤肥力，使土壤的滲水、保水、透氣能力增強，可逐年減少化肥、農藥使用量。
● 加速土壤有機物的分解，使有效養分含量明顯增加；使土壤中有效微生物迅速繁殖和不斷補充，抑制了土壤中病原微生物的侵襲和發展。
● 促進以微生物及其分解產物為食的土壤微型動物(如有益蟎、蚯蚓類和甲蟲類)的數量增加，使整個耕層的微生態系統組成發生根本變化，提高了土壤生物活性和緩衝能力。
促進植物生長發育
● 施用EM菌可增強植物葉片光合能力，如葉面噴施EM菌液的果樹，葉片增厚、發亮。
● EM菌可促進根系生長，花果期使用還能有效提高坐果率。
● 重茬地塊施用EM菌，可明顯促進長勢，提高產量。
提升植物抗病抗逆能力
● EM菌可產生大量有益物質，如氨基酸、有機酸、多醣類、各種維生素、各種生化酶、促生長因子、抗生素和抗病毒物質等，提高作物的抗逆性。
● 提高水中的溶解氧濃度，有利於根系呼吸；可提高土壤保水能力，同時可強化葉片保護膜，減少水分損失。
● 抑制有害微生物的生存與繁殖，減輕並逐步消除土傳病蟲害和連作障礙。
提高作物產量與品質
● 增加作物產量。研究表明，一茬作物每畝施用EM發酵稀釋液0.5~1公斤，增產幅度一般為：糧油作物增產10~20%以上，其中大豆可增產10%以上；葉菜類增產8~26%以上，塊根塊莖類增產幅度更大；瓜果類保花保果率提高40%以上。
● 提高作物品質。瓜果類或果樹在施用EM菌後，單果重、含糖量等明顯提高；花卉可提前半月開花，花朵增多更鮮豔，花期延長。
● 延長果品保鮮期。果樹採前噴施EM菌，不但能給葉片補充營養， 還能使果實保鮮期延長。採後用EM菌稀釋液浸泡果實2分鐘，晾乾再貯藏，同樣能使保鮮期延長。
抑制與消除雜草
● EM菌中的乳酸菌群合成乳酸和生理活性物質，可使雜草種子的種皮變軟，容易吸收水分，打破休眠，提前發芽，使其因無法越冬而枯死。
EM菌的使用方法
直接稀釋使用
根據使用目的，將EM菌原液按一定比例用水直接稀釋，用於浸種、拌種、泡根、葉面噴施和噴灑還田秸稈後翻耕等。
製作E M菌農家有機肥
就地取原料，如雜草、人畜糞便、作物秸稈(切碎)、莖葉、穀糠、鋸木屑均可， 混合比例為原料500~1 000份、EM菌1份、紅糖1份、清水30%~35％，先溶化紅糖，倒入水中，再加入EM菌，然後與原料混合拌勻，堆垛壓實，用塑料薄膜密封，厭氧發酵。當發出酒麯香味或出現白色菌絲時表明發酵成功。發酵堆肥可保存1~3個月。
用EM菌發酵糞水作追肥
混合比例為EM菌1份、紅糖1份、糞水200份的比例混合攪拌，蓋上薄膜，每1~2天攪動一次，5~7天即成，用時加水，每斤加水200~300斤稀釋使用。
EM發酵液在各種作物上的使用方法
● 水田作物(以水稻為例)
底肥：對有肥田草和稻草還田的田塊，每畝播灑0.5公斤EM發酵液製成的500公斤稀釋液漚田；沒有肥田草和稻草還田的田塊，每畝施10公斤EM發酵稀釋液發酵堆肥。
浸種：用0.5%EM菌發酵稀釋液浸種2~4小時後播入秧場。
追肥：秧苗長到2~3片葉時，用0.1%EM菌發酵稀釋液噴灑兩次，提高成秧率；插秧前，用0.2%EM菌發酵稀釋液泡根5分鐘，保苗促長；移栽期，追施EM菌發酵稀釋液堆肥每畝50公斤或用EM發酵稀釋液隨水澆灌；分蘗期、孕穗期、抽穗期，分別用0.2%EM菌發酵稀釋液噴灑葉面，也可視長勢每周葉面噴施一次1%EM菌發酵稀釋液。
除草：秋收後，每畝撒施200~300公斤EM菌發酵稀釋液發酵堆肥，讓草籽打破休眠常規，反季節提前萌芽，不能越冬而死。第二年春，噴施一次0.2%EM菌發酵稀釋液，加快殘餘草籽發芽，然後通過春耕翻地和旱地鋤草，將雜草漚死或除去。
● 旱地作物(麥類、豆類、薯類和草本油料、棉、麻類、甘蔗、菸葉、蘆筍、牧草等)
土壤處理：翻耕整地時，每畝施EM菌肥堆肥50公斤，入土20公分左右。或用0.2%EM菌發酵稀釋液均勻噴灑一遍土面。
苗期：用0.5%EM菌發酵稀釋液將種子浸泡後播下，出苗後，用0.1%EM菌發酵稀釋液噴灑一次。移栽的種苗以0.2%EM菌發酵稀釋液泡根5分鐘後定植，或用0.1%EM發酵稀釋液澆根一次(泡根後的稀釋液可用來澆根)。
生長期：視作物長勢，噴灑1%EM菌發酵稀釋液，一茬作物應不少於2~3次，次數越多效果越好，最好每週一次。亦可用EM菌發酵稀釋液糞水稀釋液澆根追肥，效果更好。
● 葉菜類(芹菜、菠菜、生菜、油菜、白菜、萵苣等)
種子處理：用0.5%的EM菌發酵稀釋液浸10~24小時後撒播。
基肥或根外追肥：每次每畝用70~200kgEM堆肥翻埋土中。
噴葉：用0.1% EM菌發酵稀釋液噴淋。葉至旺盛期7~10天一次，噴3次。
沾根：把EM菌發酵稀釋液按1：100稀釋成水溶液後，將苗根浸沾10分鐘後即可移栽(不帶土移栽的秧菜最好，如大白菜、小油菜等)。
● 瓜菜類(黃瓜、西瓜、冬瓜、南瓜、絲瓜等)
土壤處理：種植前一個月，EM菌配置成500~1000倍稀釋液噴灑潤濕地面再翻耕。
施基肥：種植前每畝用EM菌發酵堆肥200~300kg，埋入地裡20cm，改良土壤。
浸種：用100倍稀釋液浸泡瓜種15分鐘(硬殼瓜子要泡三十分鐘)。
移栽：用1：200的EM菌發酵稀釋液淋根。定植一周，噴灑一次。對防治蚜蟲、瓜螟和黃守瓜等害蟲有很好的效果。
保花保果：在謝花2/3時，噴灑EM菌糞水肥200-500倍和EM菌稀釋液1000倍。
每採栽一次瓜果，都要施入一定量的EM菌堆肥，給瓜果提供必要的營養。
● 果菜類(辣椒、西紅柿、茄子、豆角、花菜等)
土壤處理：種植前一個月用EM菌發酵稀釋液每畝2~3kg按1：1000兌水噴淋地面再翻耕。半個月後再每畝300kgEM菌堆肥，埋入地裡改良土壤。
浸種：用1：500EM菌發酵稀釋液0.5~1小時。
定植：用1：800EM菌發酵稀釋液作定根水，移栽一個月後開始每20天用1次EM菌糞水肥1：200兌水澆根，或用EM菌堆肥每畝70-200kg翻埋土中。
追肥：瓜果後每畝用EM菌發酵稀釋液3kg按1：800兌水噴灑葉面和果實1次，以後每採摘一次按1：1000EM菌發酵稀釋液噴灑1次。
● 園林果木(果樹、茶樹、桑樹、中藥材、花卉等)
整地育苗：苗圃整地時，施入EM菌發酵稀釋液堆肥；育苗中，先用0.5%EM菌發酵稀釋液浸種，再用0.1%EM菌發酵稀釋液澆根和葉面噴施。
底肥：秋季採果(葉)後和春季芽膜萌動前，各施1次每畝50公斤EM菌發酵稀釋液堆肥作基肥。
現蕾期、謝花期：各噴灑一次0.1%EM菌發酵稀釋液，提高坐果率(開花期不宜噴灑)。
穩果期、壯果期和採茶、摘桑葉前：各噴施一次0.1%EM發酵稀釋液(視長勢可適當增加噴灑次數)，有利於提高產量和品質。
防冬季落葉：每年秋天至冬天前，每隔15天噴灑一次0.1%EM發酵稀釋液，可開防止冬季落葉。